Qt дорос до версии 5, повзрослел. Отныне для Windows не требуется прописывать переменные окружения и пути. Каждая сборка не зависит ни от чего, система ничего "не знает" ни об одной из них. Это здорово, поскольку теперь программисту не нужно думать о том, где его Qt "наследил".
Что же касается самих сборок, с ними не всё так гладко, как хотелось бы. В идеале я должен, например, с помощью configure указать, куда положить новую сборку (mingw48_32), а при выполнении mingw-make все собранные файлы должны оказаться там, куда я указал, а не вперемешку с сырцами. Увы, пока мечты. Мечтой пока что остаётся получить копию установленной заранее папки mingw48_32 (с Assistant`ом, Designer`ом и тд). После сборки из сырцов с параметрами по умолчанию таких файлов нет.